Włodzimierz Kołos przyczynił się podobnie znacznie, wraz ze współpracownikami z Wydziału Chemii UW, do rozwoju teorii oddziaływań międzycząsteczkowych. Był jednym z pionierów rachunku zaburzeń o adaptowanej symetrii (ang. symmetry adapted perturbation theory, SAPT) podobnie prac nad nieaddytywnością oddziaływań międzycząsteczkowych.